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行政院農業委員會臺中區農業改良場

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第62期--1999年3月出刊

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文心蘭 '草莓' 品種5.8S rRNA基因與內轉錄間隔區之選殖

研究彙報第六十二期 , Page 31-40,出版時間:1999- 3, 詳細內容

  

文心蘭 '草莓' 品種5.8S rRNA基因與內轉錄間隔區之選殖

作者:蔡奇助 黃勝忠 易美秀

   

摘  要

  本 研 究 設 計 一 組 核 酸 引 子 (primer),序 列 分 別 為 IT1: 5' CGTAACAAGGTTTCC 3'和 IT2: 5' AGTTTCTTCTCCTCC 3',利 用 聚 合 酵 素 連 鎖 反 應 (polymerase chain reaction, PCR),可 以 將 文 心 蘭 '草莓 ' 品 種 (Oncidium vokelanti cv. "Strawberry")的 5.8S核 糖 體 核 酸 (rRNA)基 因 與 內 轉 錄 間 隔 區 (internal transcribed spacer, ITS)有 效 複 製,複 製 產 物 長 為 699 bp,定 序 後,利 用 Blast分 析 與 送 入 基 因 庫 (GenBank)內 其 他 高 等 植 物 相 同 區 域 比 較,發 現 PCR複 製 的 DNA片 段 中,有 26 bp屬 於 18S rRNA基 因 的 3'端,而 52 bp屬 於 26S rRNA基 因 的 5'端。因 此,內 轉 錄 間 隔 區 (ITS)實 長 為 621 bp,此 區 包 含 ITS1, 5.8S rRNA基 因 與 ITS2等 三 區,其 長 度 分 別 為 211 bp, 163 bp及 247 bp,G+C百 分 比 分 別 為 54.5, 58.3及 56.3%。

關鍵字: 文 心 蘭、聚 合 酵 素 連 鎖 反 應、5.8S核 糖 體 核 酸 基 因、核 糖 體 核 酸 內 轉 錄 間 隔 區。

Nucleotide Sequence of 5.8S Ribosomal RNA Genes and of Internal Transcribed Spacers from Oncidium vokelanti cv. 'Strawberry'

Chi-Chu Tsai, Sheng-Chung Huang and Mei-Shiou Yih

Summary

  The nucleotide sequence of internal transcribed spacer (ITS) region between 18S and 26S ribosomal RNA (rRNA) genes of Oncidium vokelanti cv. 'Strawberry' was amplified by polymerase chain reaction (PCR). The primers for PCR, IT1: 5' CGTAACAAGGTTTCC 3' and IT2: 5' AGTTTCTTCTCCTCC 3' were designed for amplification and sequencing. The length of PCR product was 699 bp. Compare the obtained sequence with the sequence of ITS from other higher plant species, showed that the cloned sequence contained 52 bp of 26S rRNA gene, ITS region and 26 bp of 18S rRNA gene. Thus, the length of ITS region was 621 bp, including 211 bp of ITS1, 163 bp of 5.8S rRNA gene and 247 bp of ITS2. The G+C contents were 54.5, 58.3, and 56.3%, respectively.

Keywords: Oncidium, polymerase chain reaction, 5.8S rRNA, internal transcribed spacer.

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